新華社旗下《瞭望東方》週刊報導，2003年6月三峽大壩蓄水135米水位後，庫區水域安全情勢發生了變化。在前國務院總理李鵬主理三峽工程時，中國官方一直堅持「大壩具較強抗戰能力」，直至2003年5月底，中國某些三峽專家還在堅持同一論調。
報導指出：建成後的三峽大壩極有可能成為國外敵對勢力和恐怖活動襲擊的目標。由於江面變寬、水流變緩，三峽大壩的通航格局發生了較大的改變。據指出，「一旦發生恐怖份子劫持上千噸、甚至上萬噸的船隻對大壩進行衝擊、爆炸和燃爆的事件，不僅會對大壩本身的安全構成極大的威脅，同時也可能產生極壞的政治影響」。
報導承認，以前航道行駛的多是兩三百噸拖輪，現在連一些個體私營公司的駁船都在1000噸以上，各民營和地方輪船公司也大都是2000-3000噸的自航駁船，最大的可達到4500噸，加上大型汽車滾裝船、集裝箱船等，航行在庫區水域裡的船只是越來越大、越來越多。而隨著大壩2009年蓄水達175米後，萬噸級船隻更可直達重慶。
就在這次官方異動之前不久的11月17日，中國悄悄地宣布：免去國務院三峽工程建設委員會辦公室主任郭樹言的職務，連帶郭樹言的副手何文彬也一併調走；而在10月底，中國國務院總理溫家寶就曾到過三峽庫區視察。由於這一連串異動都在一段短時期內發生，更令外界覺得事件並不尋常。
在郭樹言下臺前不久的2003年05月28日，中新社還發報了一篇報導，指「實驗表明，因三峽大壩是混凝土大壩，壩高和壩寬都超過100米，能夠抵禦一定的常規武器的襲擊」。
中新社的報導指：從李鵬主政的1978年到1988年，專家連續進行了三峽潰壩實驗，研究三峽大壩在遭受核武器襲擊後，潰壩洪水的影響範圍，以及減少損失的對策。
當時的專家認為：三峽潰壩不致對下游六省一市造成毀滅性破壞。理由是，「戰爭打響前，三峽水庫可以在5至7天內將水位降到安全位置，這樣將大大減小潰壩所造成的災害。」但很明顯，恐怖份子絕對不會給予政府5至7天把水位降到安全位置。問題是，當時的專家怎會認為所有戰事政府都會有5至7天把水位降到安全位置？
可怕的是，炸彈襲擊在中國特別是受三峽影響的地區並不罕見：2002年4月3日，四川省成都市中心天府廣場發生一起爆炸案，造成3人不同程度受傷，雖說犯罪嫌疑人事發不久即被警方抓獲，但這事件也說明在中國曉得製造炸彈和獲得炸藥並不是一件難事。
《瞭望東方》報導，重慶市公安局水警總隊在調研的基礎上提出了人防技防、雙管齊下的措施。人防上主要是靠管理逐漸強化，技防上主要靠資源配置的逐步落實，提出的具體措施如下：
一是在夔門水域進口處和大壩水域，設立緊急情況下兩道攔河鋼纜網、尼龍網、漁網，根據不同情況，採取破壞船隻螺旋槳或攔截危險船隻衝擊大壩；
二是新建或改建3000噸左右的特製自航駁船，具有防撞、防爆、滅火、運送物資等多種功能，配合高速水翼艇，對危險船隻進行機動攔截；
三是利用大壩至萬州水域存留的12個航標建立管控網路，對過往船隻進行登記管理，掌握所有上下水船隻的航行和貨運情況；
四是對載貨1000噸以上，載客300人以上的游輪安裝GPS衛星定位系統，各地碼頭主要客貨躉船安裝攝像裝置，將絕大部分船隻納入警方的監視之下，一旦發現緊急情況，便於沿江各地先期就近處置或聯運處置。
據《瞭望東方》瞭解，目前這一計畫還只是停留在重慶水警總隊的調研報告裡，可行性和可靠性到底有多大不得而知。然而，隨著蓄水至135米，確保三峽大壩安全，便成為庫區水上公安機關無法迴避、又亟待解決的問題。
近日，《瞭望東方》記者深入三峽庫區重慶水域的萬州、奉節和巫山3地實地採訪發現，三峽庫區安全尚面臨諸多難題，難以應對大的突發事件：
一難：警力不足。萬州水上公安分局僅有100餘名干警，轄區114公里長江段共有鄉鎮碼頭50多個，其中最偏僻的地方離水上派出所有近50公里。萬州各地方輪船公司開通了萬州至南京、宜昌等10多條航線，按照執法要求，每艘船上至少要有2名乘警，但萬州公安局水上分局只能在大一點的客船和重要的航段派1名乘警，小客船則沒有乘警可派。
二難：船上案件移交難。船上的案件流動性，加之警力不足，很難做到人贓俱獲，偵破難度不小，並成為破不了的「死案」，這即是說，誰立了船的案，就有可能會降低其所在單位的破案率。
三難：長江水域沒有一部統一的水上法律法規。目前，長江流域各地水上公安機關制定的地方性法規在諸多方面存在矛盾和「打架」現象，地區之間、水上與地方公安機關之間、水上與港航公安機關之間，都有各自的執法標準和辦法，一旦出現糾紛或案件，往往各行其是，容易給違法犯罪份子以可乘之機。
《瞭望東方》引述專家建議，「有關部門應早打算、早研究，從長計議，及早制定出一套切實可行的、能應對各種危及三峽大壩安全的突發情況的對策」。
值得注意的是，中國的新領導層對三峽工程明顯採取了較透明和較負責任的做法：雖然現在三峽工程已經幾乎完成，安全隱患已經形成，但早日揭露問題和早日討論問題，總比駝鳥政策來得務實。
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