国亲当场提出诉讼的事实及理由包括，十几种可能影响票数的不合理现象；无效票高达33万多票，比前两次大选多出二十几万票；公投法明定不得同时举办，但民进党宣传“公投100”，“总统选一号，公投盖圈圈”，对原告造成选举不公；枪击案后资讯不立即公开，对选民的投票意愿产生影响，也影响另一组候选人正常活动；启动国安机制造成军宪警无法投票。
绿营则强调，不论蓝营如何主张，公投绑大选、枪击案、国安机制启动等最多属于选务瑕疵，不能适用国亲提起诉讼依据的总统、副总统选罢法104条第1项“当选票数不实，足认有影响选举结果之虞者”。绿营表示，总统同意全面验票的前提只限于前述条文，有关选务瑕疵、选举违法等，与当选无效的诉讼无关。
蓝军律师姜志俊表示，选罢法102和104条虽不同，一为选举无效，一为当选无效，但两条文有竞合问题，亦即虽然蓝军提起当选无效之诉，但当选的票数不实，有可能是当选人或选务机关以其他违法的手法造成，公投绑大选等事件当然与当选无效诉讼有关。
绿营律师强调，如果蓝营真心要验票，他们才会同意，但若一直以选务瑕疵掺入本件诉讼，最好先提起选举无效诉讼，“把选举无效官司打个一两年，再来验票”！
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