中国时报报导，据报导，7月28日晚上，黄正一在使馆处理工作时吃下了在附近购买的三明治，之后因腹痛和腹泻回家。翌日，他前往北京市光华路的一家诊所就医，在打点滴过程中出现呼吸困难而死亡。
韩国驻中国大使金夏中称，黄正一从办公室回家后，腹泻症状没有停止，因此次日上午8时30分左右亲自开车前往外国人经常出入的“比斯塔门诊部”输液。该门诊部担心黄正一出现脱水现象，开了输液处方，但开始输液后，黄正一就出现了呼吸障碍症状。报道还称，这家诊所不具备急救诊疗设施的门诊部，急忙拨打911后进行心肺复苏抢救，但20分钟后急救队抵达时黄正一已停止呼吸。医院在上午11时30分确认黄正一死亡。
据推测，导致黄正一死亡的原因可能有两个主要环节：一是前一天晚上所食用的三明治有问题，二是“比斯塔门诊部”给黄正一开的输液药品为假冒伪劣品，或者输液速度有问题等。不过，官方已于30日下午对死者进行了尿检和剖检，正式的死因还没有公布。
香港人权民运信息中心引述北京一名医生说，黄正一突然死亡原因有四种可能性，一是他患有严重心脏病；二是所吃的三明治含有大量有害物质；三是诊所打点滴用的是假冒劣质药品；四是打点滴出现人为错误，例如输液速度过快。
信息中心曾致电有关诊所查询，诊所的医务人员表示，公安已封存了全部液体药物及医疗纪录作调查。据称，这名医务人员不排除黄正一因为上述等原因而死亡，但强调要等调查结果。
信息中心又引述负责解剖黄正一尸体的朝阳区医政科一名医生表示，昨天才做解剖，要在两个星期后才有死因报告出来，但这名医生也不排除黄正一死於上述等原因。52岁的黄正一担任南韩驻中国大使馆政务公使之前，曾任南韩驻日本及伊拉克总领事，目前负责朝鲜六方会议事宜。
有消息说，中国方面非常重视大使级公使黄正一死亡事件，承诺会迅速向韩国驻华大使馆提供死因分析结果。韩国驻华大使馆在大使馆总馆一楼设置了黄正一的灵堂，接受来客吊唁。
香港大公报报导，中国外交部发言人办公室就韩国驻华公使在北京突然去世表示，中共政府对黄正一先生的不幸去世表示哀悼。黄正一生前为发展中韩友好合作做出了积极的贡献，我们为失去这样一个朋友深感痛惜。外交部称，关於黄正一先生的死因，目前中韩双方的专家正在进行调查。中共政府将及时对外公布调查的结果。
至於中韩双方是否就此成立专门的调查小组，调查小组组成人员是否包括外交、食品药品监管部门、卫生部门和警方等，调查将持续多长时间，该事件是否会对中韩关系造成影响等问题，外交部官员并未予回应，但表示，将在第一时间公布事故的调查处理情况。
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