三峡大坝工程引发的争议，连向来只是橡皮图章的全国人民代表大会也曾罕见地强烈反对，但北京当局仍执意兴建，前总理李鹏留给后世两个遗绪，一是天安门事件，另一个就是三峡大坝工程。
报道说，中共建政五十四年来拿人民的生命当赌注也不是第一次，但这次三峡大坝的冒险则是更多元更全面，从财政经济、科学地理到社会人文。
整个三峡发电工程完工后将有一千八百二十万千瓦的供电能量，相当于二十六座核子发电厂，或十座五千吨燃煤的火力发电厂。九十年代大陆经济学家估计大坝发电不但可以解决当年的缺电问题还可卖电充裕国库，但近年来大陆电价跌跌不休，如今看来三峡大坝的发电工程到底能不能赚钱不无疑问。
大坝的安全性也令人担忧。水坝结构出现细微裂缝，已有官员因供应建商劣等建材而遭逮捕。就算大坝底部结实应无问题，但问题是大坝沿岸土石流情况严重，将影响坝体安全，三峡沿岸土石流严重的情形让人怵目惊心，连客轮上的舵手都能一一指陈。
环境冲击、生态浩劫是另一大隐忧。住有三千万居民的重庆市，估计每年将排放一百二十四亿立方尺的民生废水及一百四十一立方尺的工业废水到水坝里，如此的三峡大坝好比一个巨型污水池。此外水坝每年还要承受二百一十二亿立方尺的土石淤积，如何排除这些土石淤泥则让负责工程发电的工程师头痛不已。
三峡沿岸一百三十万居民被迫迁移，政府说他们的生活将比以前改善，但事实上只有公务员及共产党工才是受惠者，因为他们优先获得配备房屋。但一位六十岁的老农说，“一般老百姓都遭殃。”像他一辈子就靠果园过活，除了种橘子之外，什么都不会，如今被迫放弃家园，只能在奉节拾荒过活。
现在大坝开始蓄水，水位平均每天上涨三公尺，几百万只水鼠爬上岸来，当地政府发动民众灭鼠，而被毒死的水鼠则全部流回水坝内。
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