今天日本的一都一道二府四十三县都有护国神社。
二战结束后，盟军占领日本。1945年12月15日，盟军最高司令部发布禁止政教合一命令，禁止日本政府与神道的各种联系，把神道作为一种独立的民间宗教处理。从此，神道教超宗教的地位终结。
盟军总司令麦克阿瑟曾准备焚毁靖国神社，但罗马教皇派出特使劝告麦克阿瑟，称纪念为国家战死者是人类“自然法”，故麦克阿瑟保留了靖国神社，但在“钦定”《日本国宪法》中确定日本是个政教分离的国家。靖国神社和各地护国神社成为宗教社团法人，经费均由民间募集。
靖国神社与日本战犯
远东国际法庭以及其他同盟国国内法庭，对5000多名日本军人和政府官员进行起诉，分为甲、乙、丙三级战犯。
1952年日本发起有4000万人签名的“战犯赦免运动”，1955年日本众议院通过了《战犯释放问题》决议案，1958年5月，除在中国、苏联的战犯外，关押在日本和其他盟国的全部战犯被释放。岸信介首相即是其中之一。
1959年，靖国神社将约2000名死去的乙、丙级战犯设立了牌位。但他们还不敢把甲级战犯灵位放入。
在等了将近20年后的1978年，靖国神社终于为28名甲级战犯中的14人设置了灵位，他们是：东条英机、土肥原贤二、松井石根、木村兵太郎、广田弘毅、阪垣征四郎、武藤章、松冈洋右、永野修身、白鸟敏夫、平沼骐一郎、小矶国昭、梅津美治郎、东乡茂德。
自此，日本政要参拜靖国神社成为一个瞩目的政治话题。
除日本外，参拜靖国神社还有谁
由于未遭日本侵略历史之痛，一些国家并未将靖国神社视为军国主义象征，而是普通意义上的民族英雄纪念碑，故派出官方代表团前往参观祭奠。
派军队代表团前往靖国神社参观的有：美、英、德、意、法、加、葡萄牙、泰国、阿根廷、秘鲁、智利、巴西等国。
国家元首或政府高官率团参拜靖国神社的有：泰国、印度、斯里兰卡、缅甸、印度尼西亚，阿根廷、立陶宛等。
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