不过有数百名怀疑是参加过中正纪念堂集会的群众，在集会结束之后，转移到附近总统府前凯达格兰大道继续抗争行动。群众高呼反对陈水扁总统的口号，并要求政府公开3-19枪击案的真相，以及选举过程的疑点。
警方架起铁马防止民众冲向总统府，并劝导群众离开。至4号凌晨，警方劝喻无效，大批手持盾牌的武装警察对群众展开强制驱离行动，引发警民流血冲突，估计有10多名群众受伤或休克送院，上百人被带回警局调查，亦有警员报称受伤。
这次是3-20总统大选之后，由国亲联盟发起，持续两星期的台北市群众街头集会，首次发生警民流血冲突。
*集会持续、本质改变*
台湾时事评论员南方朔表示，开放性的群众运动会有不同背景的人参与，并且会改变集会的本质，因此这次冲突的民众很难定义为国亲支持者，估计是小部份较激进，而且不绰举结果的民众引起的个别冲突。
南方朔说：感觉到一种新的、好像不是泛蓝、也不是泛绿的群众，慢慢形成，他们的诉求是真相这一点要突显出来。
*学生继续绝食、要求蓝绿双方道歉*
另一方面，2号晚开始，由8位来自不同大学的台湾学生发起，在台北市中正纪念堂进行的绝食抗议行动，至4号晚7点半，达到48小时，在场有上百民众支持他们的行动。学生代表陈同学表示，学生以接力方式，每次一同绝食静坐的人数约10人，每人按照自己的体力及意志，维持10多小时至40小时不等。
陈同学并表示，5号将会有几十名学生由中部北上支援，估计加入绝食静坐的学生将会超过一百人。他们的主要诉求，是蓝绿双方的领导人，都要为过去几年的政治乱象向台湾人民道歉；政府尽快成立独立枪击案真相调查委员会等等，希望朝野领导人，在9号之前，尽快回应他们的诉求。
陈同学说：如果4月9号朝野双方无给予善意及明确的回应，之后学生不排除整个活动会变更型态，然后对朝野双方施更大的压力。
*吾尔开希：3-20后群众运动跨越党派*
目前定居台湾的前中国大陆民运人士吾尔开希，3号晚到中正纪念堂声援学生的绝食行动。吾尔开希认为学生的绝食行动，得到社会普遍的认同，也代表3-20之后，台湾的民众运动已经扩大。
吾尔开希说：3-20之后的大部份群众运动是有明确的政党色彩，而这场绝食行动，第一不是政党组织，第二是跨越了蓝绿的诉求，对双方都有一种很负责任的批判的一场运动，所以我觉得是跨越了3-20之后的所有群众运动。
身兼族群平等联盟召集人的台湾导演候孝贤，3号晚亦有到场声援绝食学生。候孝贤表示，学生的自发性很强，而且出发点很单纯，目前族群平等联盟只是给予精神上的支持。
候孝贤说：可能会发动一个摄制组，来拍摄学生这种活动状况，纪录他们的状况，可能以后在教育上或其他方面都很有用。
