国安机制立即启动
不幸事件发生后，政府的国家安全机制立即启动，全面提高社会安全维护等级；中选会并宣布今日的总统选举及公民投票投开票作业，照常举行。国际媒体立即报导此事，引起友邦震惊。美国布什政府发表声明谴责暴力，肯定台湾民众在此事中展现的冷静态度以及选举照常举行的决定，并相信选举结果将有助于台湾的繁荣、安全和更好的治理，日本首相小泉也转来关切慰问。
陈水扁与吕秀莲昨日下午一时四十五分，当车队抵达南市金华路三段时，在金华路三段十二号附近遭到攻击。陈总统中枪后，直到持续疼痛了数分钟之后才发现自己身上有血迹，随后立即紧急前往奇美医院。
目击者画疑凶画像
警方目前正追查目击者通报的两辆可疑机车，目击者说，机车疑从金华路小府城香肠熟肉对面车道急速转金华路，并朝着总统车队前进。目击者发现可疑嫌犯后，在红色便条纸上画下嫌犯特征，两名中年男子年约四、五十岁，一人身材壮硕，一人精瘦。
包括警政署、台南市政府、连宋竞选总部，昨晚都宣布提供检举破案奖金，金额总计达二千三百万元。
陈水扁的枪伤在下腹部，肚脐下三公分处有长达十一公分、深两公分的伤口，所幸未伤及内脏，其皮下共缝十二针，皮上二十针。子弹弹头则在衣服内寻获。吕秀莲则是右膝盖有一公分穿透伤。
由于局部麻醉，总统在手术过程相当清醒，他告诉所属，“我没事，大家放心，我不会被一颗子弹打倒”。
总统并且打电话给总统府秘书长邱义仁、行政院长游锡堃，指示政务交付。也与扁妈与夫人吴淑珍通电，请她们不要担心。
奇美医院在下午四点完成治疗后，将陈水扁总统及副总统吕秀莲送往加护病房观察。陈总统晚间七点十分离开奇美医院搭乘空军一号返回台北。
蓝绿停止造势活动
面对这起严重事件，国亲联盟总统候选人连战宣布取消选前之夜的所有国亲大型选举造势活动，避免引发群众情绪性反应。连战呼吁政府在选前应宣布枪击事件完整真相向全民报告，让民众有所了解。
民进党陈吕竞选总部也宣布停止晚场的连线造势活动，并谴责暴力，呼吁全国民众要维持和平、理性，为陈总统、吕副总统祈福。
国安局在晚间十一点召开记者会，国安局长蔡朝明向社会大众致歉，愿意负起所有责任。总统府侍卫长陈再福说明，总统中枪后之所以送往奇美医院，系因奇美医院为国安局的地区特约医院，因此送往该院，座车在四分多钟即到达医院，并无延误。
