很多人對「有機的食品是否更營養」有疑問，其實，有機食品不是增加營養，而是減少傷害。美國斯坦福大學的科學家在《內科年鑑》發表的報告說，在分析了5000多篇學術論文，綜合過去40年中237種有機食品和普通食品的比較分析後指出，有機食物對成年人的健康效果不顯著。領導斯坦福大學和帕羅奧多退伍軍人醫學中心研究小組的斯潘格勒說：「人們選擇購買有機食品的原因很多，其中一個重要考量就是這類食品更健康。」斯潘格勒說，她和同事分析了200多份研究結果。這些研究有的比較食用有機食品和傳統食品人們的健康，更普遍的是比較有機食品和傳統食物中養分和污染物的含量。這些食物包括有機和非有機的水果、蔬菜、穀物、肉類、家禽蛋類和牛奶。斯潘格勒和同事發現，在有機的和傳統的植物或動物產品中，維生素含量沒有差別，唯一的營養素差別是，有機食品含的磷稍多一些。還有少量研究發現，有機牛奶和雞中，也含有稍多的歐米伽-3脂肪酸。有三分之一的傳統食品含有可以檢測到的農藥殘留，而有機產品樣本的比例為7%，另外跟傳統食品肉類相比，有機豬肉和雞肉含有對三種以上抗生素有抗藥性的細菌要少33%。
目前有機食品的主要優勢是安全性比普通食品高，因為其要求生產環境潔淨、無污染；在生產過程中不允許使用人工合成化學物質，例如農藥、化肥等。95%原材料必須符合有機食品標準，對廠區、設備、工藝、衛生條件和生產人員有嚴格要求。美國兒科學會在一份名為《有機食品：健康及環境優勢和劣勢》的報告中指出，與傳統食品相比，有機食品在殺蟲劑殘留水平方面優勢明顯。以有機方式飼養的家畜染有耐藥細菌的可能性較低，因為在飼養過程中，它們只在生病時才會服用抗生素。但有機食品在維生素、礦物質、抗氧化劑、蛋白質等營養成分含量上與傳統食品並無區別。報告認為，「從長遠角度來看，沒有直接證據表明，食用有機食品能改善健康或降低生病風險」，科學界迄今尚未就這一問題徵集大量志願者、開展大規模測試。這份報告同時發表於正在美國新奧爾良舉行的美國兒科學會年會及《兒科學》期刊網路版上。報告作者、美國兒科學會營養委員會委員珍妮特·西爾弗斯坦說：「最重要的是孩子們應該多吃蔬菜、水果、全穀物、低脂或脫脂奶製品——不管它們是‘有機’的還是‘傳統’的，這些飲食已被證明對健康有益。我們不希望有些家庭因為選擇價格昂貴的有機食品而減少健康食品的總體攝取量。」
2015年10月份環保領域的權威雜誌《環境健康展望》發表了一篇原創科研論文，作者們發現美國加州薩利納斯地區與奧克蘭地區兒童服用有機食品可顯著降低有機磷類殺蟲劑代謝物和2,4-D（2,4-二氯苯氧乙酸，除草劑）的尿濃度量。瑞典環境研究所也對有機食品的功效展開了最新的研究。科學家招募了三個家庭，家中分別有3對父母和12歲、10歲及3歲的5個孩子。家庭每個成員，首先吃一個星期的傳統食品，接下來再吃兩個星期的有機食品。在測試期間，每個家庭成員將晨尿樣品供科學家對其中的已知12種農藥或代謝物作分析。結果表明，當家庭成員改吃有機食品時，他們體中的農藥含量急劇下降。「改吃有機食品促使人體中農藥含量平均下降了9.5倍」，首席研究員Magnér 說：「孩子體中的農藥含量下降幅度最大。」農藥離開人體的速度之快，使得他和同事們都很驚訝。據Magnér 透露，「如果你擔心化學農藥影響身體健康，你可以通過食物來控制。」Magnér 認為，種植有機食品還可以幫助那些經常暴露在大量農藥中的人，如農民，減少與農藥接觸的時間。
2014年澳大利亞皇家墨爾本理工大學（RMIT University）的研究顯示，僅短短一星期攝取大部分(並非全部)為有機食物的飲食組合，可驚人地減低90％殺蟲劑的接觸量。研究人員發現，參與者前一週食用傳統食物，後一週攝取大多是有機食品，尿液中二烷基磷酸鹽的濃度降低了89％。該研究主導研究員奧茨(Liza Oates)博士說：「研究結果表明，參與者轉而食用有機食物只有短暫一週，體內農藥殘餘量便大為減輕，這亦意味有機飲食預防體內農藥殘餘量的取向，發揮了關鍵作用。」研究人員隨機分配13名成人，他們攝取超過80％的「普通」飲食，亦即生長中使用農藥、化肥和經過轉基因的農產品，7天之後，所有參與者轉換至80％以上的有機食物。飲食控制期間，每餐後的尿液樣本皆採樣檢測。研究小組檢測參與者尿液的6種化學物質濃度──二烷基磷酸鹽(dialkyl phosphate, DAP)家族，這些是人體分解有機磷殺蟲劑，所產生的各種化學物質。
奧茨博士表示，傳統的糧食生產通常使用有機磷殺蟲劑，這些毒素會對昆蟲神經系統起作用，同時也阻斷人體某種重要酵素(酶)生成。即使這些化學物質在體內濃度相當低，其他新近研究亦表達了其對人體健康影響的關注。美國哥倫比亞大學、加州大學伯克利分校和曼哈頓西奈山醫院的科學家，對那些懷孕期間接觸過較高劑量的有機磷酸酯類農藥的女性和其孩子進行了數年跟蹤調查發現，上小學時，這些孩子的智商要比其他孩子平均低好幾分。近日研究也發現，在母親子宮中接觸過毒性農藥的兒童，他們入學時的智商比沒有接觸過毒性農藥的要低。此外，研究所得出的另外一個結論是：如果母親在懷孕時曾經接觸過有機磷農藥，那麼這些兒童的智力會表現出更大的落差。
美國環保團體環境工作小組（EWG）每年採用美國農業署的研究數據，公布蔬果農藥殘留排序清單。EWG分析，全然避免食用「12種骯髒蔬果清單」(Dirty Dozen List)中的傳統農產品，亦就是12種污染最嚴重的蔬果，進而選擇「15種乾淨蔬果」(Clean Fifteen) 清單中的食物，亦即15種最不被污染的農產品，便可降低80％的農藥負擔風險。美國非營利組織EWG公布2014年農藥殘留最高的12項農產品：蘋果、草莓、葡萄、芹菜、菠菜、桃子、甜彩椒、油桃（進口）、黃瓜、櫻桃、西紅柿(番茄)、豌豆（進口）、土豆(馬鈴薯)。其次，亦可經由多吃素的方式，減少毒素攝取，尤其是多食用有機食品，及避免食用清單中12種骯髒蔬果。2010年的研究揭示，進入佛教寺廟生活5天，採用與僧人相同的生活方式，包括不吃肉，尿液中的抗生素和鄰苯二甲酸鹽(phthalates)濃度出現了急遽下降的跡象。
以下是美國非營利環境工作研究組織所評選的最乾淨水果。
洋蔥：洋蔥製造自己的防護品，含有硫化合物，阻止昆蟲咀嚼。雖然農民在生長季節初期噴灑農藥，殘留物在收割時因外層的脫落而同時被除掉了。
鱷梨：大部分的農藥是堆積在果皮上。
甜玉米：殘留農藥在外殼上面。
鳳梨：噴灑在生長季節初期便噴灑了農藥，所以收穫後殘留極少。而極少的殘留也只是在厚厚的外皮上。
芒果：農藥會殘存在外皮上。
甜豌豆：受他們的豆莢保護。
蘆筍：生長很快，幾乎沒有時間給昆蟲攻擊。
獮猴桃：草蛉和寄生蜂幫助控制喜歡吃獮猴桃的害蟲。
捲心菜：雖然噴灑農藥，但吸收農藥外葉銷售前被丟棄。
茄子：茄子有一個光滑的表面，農藥容易掉落。
甘藷：甘藷有內置的防禦。如果被咬，它會滲出一乳白色汁液把昆蟲口黏住。甘藷在高溫和高濕下自已癒合。這會導致外皮增厚，提供保護防止被傷害和產生疾病。
而諸如哈密瓜、西瓜、柚子等水果雖然在種植過程中也被噴灑殺蟲劑，單由於受到厚的果皮保護，殘存的化學藥劑均留在厚厚的外皮,而我們不吃皮的。
只要記住，無論你選擇傳統或有機的，最好還是多吃水果和蔬菜。而且不管購買任何蔬果，都要清洗或削皮後才可食用。專家建議：清洗的方法有很多種，可以先浸泡後再多換幾次水，或是將自來水開細細的一直線，蔬果盡量離水龍頭近一點，讓水慢慢地流動，注意水不能開太強，否則水泡會使余氯消失，所以要注意水流大小。
