二○○八年國民黨重新執政後，臺灣首度以「中華臺北」的名義，用觀察員的身份，出席世界衛生組織大會。但民進黨立法委員披露，世衛組織內部去年九月曾經發給會員一封信函，當中明確定義「臺灣為中國的一個省」。臺灣政府相關官員隨後證實，的確有這份文件。外交部次長瀋呂巡說，這絕對不是對中華民國外交空間 「合情合理」的安排。
民進黨立法委員週一上午召開新聞發布會，披露一份去年九月，由香港籍的世衛秘書長陳馮富珍辦公室發給各會員國的備忘錄。備忘錄名為 「世衛條例對中國臺灣省之執行作業準則」，其中重要規定包括：當世衛各單位收到來自臺灣官方任何訊息，必須向中國指定的聯絡點報告；如果臺灣的訊息出現在世衛文件上，必須先和中國代表團協調，獲得許可後才能刊登；同時，臺灣的所有訊息資料，必須歸在「中國」項下。
這份文件曝光，引發臺灣政壇激烈反應，立法院三個不同的委員會，藍綠兩陣營立法委員，不約而同地對外交、衛生和國家安全部門的首長提出質詢。
民進黨主席蔡英文在一場公開行程中受訪時也表態指出，這件事情是蠻嚴重的事情，如果變成臺灣參與國際組織通行模式，對臺灣的國際地位與臺灣參與國際組織的空間將受到很大的影響。
蔡英文說，二○○五年民進黨執政時期，就傳出類似事件，當時民進黨政府一再提出抗議，美國也致函世界衛生大會，表示不接受這個立場。到了二○○八年，馬政府執政後，民進黨一再提醒執政黨要注意此事，但馬政府顯然沒有把足夠注意力放在這上面。
在政府方面，總統馬英九先利用會見客人的場合，公開表示，衛生署長收到的邀請函是寫著「Minister of Health」，也就是衛生署長。在會場上，各國代表也都稱他「部長」，大陸的部長和臺灣的部長平起平坐，這是過去三十八年來沒有出現過的情況，這就是國民黨為臺灣爭取到的尊嚴。
下午，行政院再由新聞局長楊永明、外交部次長瀋呂巡和衛生署副署長蕭美玲召開新聞發布會。楊永明拿出邀請函的影本，說明臺灣參與世界衛生組織，用的是「Chinese Taipei」，中華臺北的名義。
楊永明說， 有人批評在中共設定的框架下參與是「羊入虎口」，但站在臺灣的立場，「不入虎穴，焉得虎子。」臺灣的參與，擴大了在國際上的能見度。至於馮陳富珍發出的這份備忘錄，楊永明說，世衛是聯合國框架下的組織，當然有國際現實和現行法律的規定等問題。
記者問道，以往在許多場合，中共領導人對於臺灣參與國際空間問題，都強調兩岸要協商出「合情合理的空間」，但這份備忘錄的內容，算得上合情合理的空間嗎？瀋呂巡直言，這當然不是合情合理，因為它違背了臺灣和世衛組織早先安排的名稱和身份，但為了同時滿足兩岸的政治需求，世衛組織也不得不這麼做。
瀋呂巡說，臺灣會就備忘錄內容，持續向世衛組織抗議，同時秉持「三不政策」，也就是任何東西如果沒有經臺灣同意，在臺灣背後和中共政府私自協商，臺灣政府一律認定「不生效」、「不配合」、「不承認」。
