北韓國防委員長金正日自20世紀90年代正式上臺以來，每次遇到重大局面就通過「血的肅清」來維持權力。近來為追究貨幣改革失敗的責任，他對勞動黨計畫財政部部長樸南基處以槍決等，共鏟除了100多名幹部。有分析認為，這是金正日第五次實施大規模肅清。韓國政府安全部門一位官員表示：「過去金正日一直利用 ‘肅清的恐怖’控制幹部。但似乎此次在內部遇到不少反對意見。」
1992年10月，金正日發現蘇聯海歸派軍官批判北韓體制，便鏟除了20多人，並免去300多名海歸派的職務。當時主導肅清的保衛局局長元應熙中將被破格晉升兩級，成為大將。當時金正日剛剛上任最高司令（1991年12月），通過肅清蘇聯派軍官掌握了軍權。
金日成逝世（1994年7月）後不久的1995年4月，北韓發生了「第六軍團肅清」事件。有一些人認為第六軍團（駐紮在咸鏡北道）肅清運動是政變謀反事件，但普遍分析認為：「第六軍團政治委員、咸鏡北道黨組織秘書、貿易公司總經理等20多人貪污外匯收入，擾亂指揮體系。」當時金正日派金永春（現人民武力部部長）大將前往形跡可疑的第六軍團，冷酷地處決了涉案人員。據說，被處決的軍人就達到數百人。憑藉這一功勞，金永春晉升為總參謀長（1995年10 月）。
金正日最具代表性的一次肅清運動，發生在1997年導致100多萬名居民餓死的「苦難行軍」時期。當時金正日給勞動黨農業秘書徐寬熙扣上「美帝國主義間諜」的帽子，在平壤市民面前公開處決。這實際上是將糧食短缺的責任強加給徐寬熙。當時有2000多人被肅清，罪名是「重新調查朝鮮戰爭（韓國稱‘6.25 戰爭’、‘韓國戰爭’）時期的行跡後發現有間諜嫌疑」。
但因「間諜調查」事件，出現太多受害人（包括被處決者家屬達數萬人）後，民心開始惡化，金正日便於2000年處理了所有曾經參與間諜事件調查的數十名幹部，罪名是「被權力矇蔽了雙眼，挑撥黨和民眾的關係，中了敵人的奸計」。
金正日曾於2004年將時任勞動黨組織指導部第一副部長張成澤驅逐出權力中心，2006年將部分引入市場經濟體制的樸鳳柱總理等人免除職務，但沒有達到 「血的肅清」的程度。但隨著今年初貨幣改革失敗導致民心極度惡化，金正日便斷然槍決追隨其40年的親信樸南基等人，再次啟動大規模肅清運動。北韓內部消息人士稱，政府方面聲稱幹部貪污腐敗導致民不聊生。
但內部氛圍卻與以往截然不同。北韓的消息人士稱：「如今北韓居民也已經發現問題。眾多幹部質疑‘我們到底做錯了什麼’，百姓則質疑‘肅清了又能怎麼樣’。」
近來訪問中國的北韓人當中有許多人認為「內部動盪從現在開始」。今年晚春氣溫低於正常水準，農作物凍害嚴重，化肥也幾乎斷供，預計今年的農業收成很差。韓國開發研究院(KDI)本月7日發表一份題為《2010年5月北韓經濟動向》的報告稱：「北韓的大米價格和匯率再次暴漲。」幹部階層也開始動搖。在各機關單位，如果沒有供應糧食的能力，高層領導必須下崗。
眾多老百姓抱怨說：「連樸南基都要被槍決，你算什麼？」階級秩序也開始出現動搖。韓國高麗大學教授趙榮基表示：「在世襲繼承過程中，可能會發生又一次的‘血的肅清’。」
