北韓國防委員長金正日結束了對中國的訪問，但圍繞金正日訪中，存在許多異常氛圍和疑點。原以為金正日會在訪問北京的最後一天，即6日晚與中國領導人一同觀看北韓血海歌劇團的《紅樓夢》演出，但並沒有觀看。當天還沒到晚飯時間，金正日便「閃電」離開北京。
過去在兩國外交當中，常常出現最高領導人一同觀看演出的場面。去年10月訪北的中國國務院總理溫家寶，也曾與金正日一同觀看《紅樓夢》。此次的《紅樓夢》演出安排在金正日訪中期間，並且中國中央電視臺從演出幾天前開始就在各時間段播出宣傳片，中國政府還購買了6日和7日的全部門票，因此原以為很有可能一同觀看。對於沒有一同觀看演出，北京的外交界紛紛猜測北韓對首腦會談結果不滿意。
6日下午在北京站，在金正日乘坐的專列出發（4時35分）10分鐘前，疑似中國領導人乘坐的3輛奧迪汽車駛入車站，但僅僅5分鐘後便駛出車站。從時間只有短短5分鐘來看，有可能只是同金正日進行道別便離開。此後中國中央電視臺播出了中國人民政治協商會議主席賈慶林在北京站歡送金正日的場面。
訪問中國的金正日直到回國的一刻仍做出令人捉摸不透的行動，其背景引發猜想。從北京站出發踏上回國旅程的金正日專列，歷時近16小時30分鐘，於7日晚9 時許抵達中轉站瀋陽站。考慮到北京至瀋陽的距離約為730公里，就是說平均時速連50公里都不到。有分析認為，患有慢性腎衰竭的金正日可能在其間接受了透析治療或去過醫院。還有分析認為，可能是列車停在途中進行了長時間的休息。
走下列車後，金正日在瀋陽市友誼賓館短暫休息，並前往位於瀋陽市東北部10公里的朝鮮戰爭（韓國稱「6.25戰爭」、「韓國戰爭」）參戰烈士陵進行了參拜。去年，溫家寶曾訪問位於平壤附近的朝鮮戰爭中國軍人烈士陵。
金正日在結束參拜後，沒有返回瀋陽站，而是乘坐前往烈士陵時利用的轎車前往丹東。從瀋陽至丹東約280公里。有分析認為，在過去對中國的四次訪問中，金正日都是乘專列回國，但這次打破慣例乘轎車回國，在很大程度上是為了人身安全問題。還有分析認為，金正日可能意識到了2004年4月回國時發生的龍川爆炸事故。丹東當地消息人士說：「金正日乘坐的轎車去了一趟丹東市內某處後，在下午3時55分許以轎車在前面開路，專列從後面跟隨的方式跨過了鴨綠江鐵橋（中朝友誼橋）。這可能是為了讓人猜不透金正日到底坐在哪裡。」鴨綠江鐵橋前的中聯酒店和國門酒店和金正日開始訪問的3日一樣，當天也到下午5時為止沒有接受投宿預約。
