就在農業部副部長危朝安公開表示 「國內沒有轉基因糧食作物種植」、「發放安全證書不等同於允許商業化生產」後不到一週，國際環保組織綠色和平卻指出，在對8個城市的部分超市銷售的大米和木瓜進行抽檢的過程中，發現了轉基因成分。
3月15日，綠色和平公布了最新的《超市生鮮散裝食品調查報告》，該調查報告稱，沃爾瑪出售非法轉基因大米、伊籐洋華堂超市出售非法轉基因木瓜。同時，在部分零售商銷售的蔬果樣品上，還檢測出含有國家明令禁止生產和使用的農藥。
轉基因近期成為公眾關注的熱點話題，坊間有傳聞轉基因水稻商業化有望在近期獲得審批。2010年中央1號文件提出，「在科學評估、依法管理基礎上，推進轉基因新品種產業化」。
3月3日，在參加兩會期間，袁隆平也表示，轉基因糧食既需慎重對待，也需科學對待。袁隆平稱自己願意為科學承擔風險，帶頭來吃抗蟲抗病的轉基因大米。
而根據對消費者的調查顯示，相當比例的消費者並不願意接受轉基因食品。
沃爾瑪出售轉基因大米
綠色和平的報告顯示，2009年10月至11月，綠色和平就對國內8個城市的9家大型連鎖超市的19個門店展開調查。調查中，綠色和平共在超市生鮮散裝產品（蔬菜、水果和大米）櫃臺隨機購買了83份樣品，並委託有資質的獨立第三方專業檢測機構對這些樣品分別進行轉基因成分檢測和農藥殘留檢測。
檢查結果發現，沃爾瑪、中百倉儲、伊籐洋華堂都在出售非法轉基因產品。其中，在沃爾瑪長沙黃興南路店和中百倉儲武昌區水果湖路店的抽樣中，檢測出有轉基因大米在售。而四川成都伊籐洋華堂超市雙楠店出售的是未經國家認可產地的轉基因木瓜。
綠色和平食品與農業項目主任王偉康解釋道，截至2009年11月，我國未允許任何單位或個人進行轉基因大米的商業化生產經營，因此，「此次在湖南長沙沃爾瑪超市黃興南路分店出售的轉基因大米屬於非法轉基因大米。」
此外，我國只允許在廣東地區生產特定轉基因木瓜品種，也不允許進口轉基因木瓜。而此次伊籐洋華堂超市檢出的轉基因木瓜樣品中，有的來自於海南、甚至是泰國，這都屬於違法生產經營或進口的轉基因食品。
生產商：「不存在問題」
根據綠色和平提供的抽樣產品的包裝，沃爾瑪長沙黃興南路分店銷售的「湖南貓芽米」產自汨羅市龍舟米廠，該廠位於汨羅市紅花鄉東衝村。
《每日經濟新聞》記者照著包裝上留下的電話聯繫廠家，對方承認是該廠的銷售人員，但他反覆強調該廠只負責加工，產品「不存在這個問題 （即轉基因問題）」。終不願透露加工原料的具體來源，只含糊地表示，追溯上游種子的出處可能是湖南省內的生產廠家。
綠色和平抽檢含有轉基因成分的另一種散裝大米——「銀欣雪優」的生產廠家為湖北省福娃集團銀欣米業公司。中百倉儲水果湖店的商品標籤顯示，該大米產地為湖北省荊州市監利縣。
福娃集團是由農業部等九部委評定的首批農業產業化國家重點龍頭企業，有自己的水稻生產基地，並且與華中農業大學有合作關係，而後者是我國唯一獲得轉基因水稻安全證書的單位。
在兩會期間，農業部副部長危朝安曾表示，「發放安全證書是對科學家轉基因生物技術研究工作及其成果的評價與肯定，並不等同於允許商業化生產」。他還強調，農業部從未批准任何一種轉基因糧食種子進口到中國境內商業化種植，在國內也沒有轉基因糧食作物種植。
沃爾瑪：應該是「非典型」事件
據《21 世紀經濟報導》消息 ，同日，沃爾瑪公關部門人士回應稱，「沃爾瑪正密切關注此事的進展，目前內部正在積極溝通，希望能盡早給消費者一個交代。」
「此次事件應該是沃爾瑪本土化的‘非典型’事件。」在沃爾瑪前生鮮採購部門負責人鐘升看來，從調查結果看，轉基因大米並非出現在沃爾瑪每家門店。
「問題就應該出在地方門店放權上。」鐘升認為。王偉康則認為，沃爾瑪等超市在中國的雙重標準，與國內正不斷收緊的食品安全政策相悖。
據瞭解，沃爾瑪超市在英國曾向消費者做出「非轉基因」政策承諾，即不會向英國消費者出售任何轉基因產品。
中科院院士：比喝水的危險還小
目前，轉基因食品在美國廣泛得到認可，歐洲人卻很反感。今年3月2日，歐盟委員會宣布，批准歐盟成員國種植德國巴斯夫公司研發的「Amflora」 轉基因土豆。這是歐盟近13年來首次為轉基因食品種植開「綠燈」，隨即在歐盟內部引發了一場激烈的抗議和爭論。
儘管歐委會保證說「Amflora」轉基因土豆將不會出現在歐洲民眾的餐桌上，種植這種土豆的主要目的是獲得豐富的澱粉，用於造紙等工業用途，但這並不能消除歐洲人對轉基因食品的疑慮。這一決定引發了環保組織和一些成員國的強烈反對。
在中國，轉基因棉花、番茄、甜椒等作物種植已獲許可，但尚未有主糧獲得商業化審批。
2 月24日，國家發改委副主任張曉強到武漢進行戰略新興產業發展調研時，向中科院院士、華中農業大學教授張啟發問及轉基因大米安全問題，張啟發舉例說明稱， 「食用轉基因大米帶來的危險，不會比喝水的危險更大」。據他透露，去年中國進口轉基因大豆超過4000萬噸，幾乎都榨成油被中國消費者吃進了肚子。
張啟發是湖北省綠色超級稻工程技術研究中心首席科學家。他的團隊正在研究具備不打藥、少施肥、能抗旱三重特性且能高產的超級水稻。
張啟發的講話被各大網路論壇轉載，引起了不少網友的爭議。
3 月15日，農業部網站發布《農業轉基因技術與生物安全問答》，列舉了轉基因技術在高產、抗逆、抗病蟲、提高營養品質等多個方面的優點，並明確表示，去年底獲得安全證書的轉基因抗蟲水稻「華恢1號」和「Bt汕優63」與非轉基因對照水稻同樣安全。但農業部也指出，轉基因水稻的產業應用尚需時間。
去年底我國獲得農業部頒發安全證書的轉基因水稻品種僅限於在湖北省內生產應用，且並不允許產業應用，但此次綠色和平的檢測結果卻表明，在湖北和湖南兩省的流通領域均發現轉基因大米。
網友回覆：
中共對什麼進行闢謠的時候，那個就是真的。這幾乎已經成為了一個定律。
