臺灣臺東縣關山鎮一處養豬場爆發國內豬只感染H1N1新流感首例，研判系畜主曾到中國旅遊遭到感染，將病毒傳給豬只；臺灣農委會強調，吃豬肉不會感染豬流感，只要煮熟即可。
學者建議全撲殺 防檢局稱已管制
臺灣農委會防檢局長許天來表示，這家養豬場飼養三千四百頭豬，臺東縣家畜疾病防治所於十月廿七日接獲畜主通報，有一百六十頭五週齡小豬出現咳嗽、流鼻涕、下痢等症狀，經給予三頭豬安樂死進行解剖並採樣送驗，證實有H1N1病毒。生病豬只出現三到七天的感冒症狀後，已逐步恢復健康，病豬僅剩"個位數"。有學者建議，為避免相互傳染造成病毒變異，病豬應全部撲殺，許天來強調，發病的豬場已做移動管制，等豬的病好了，一樣可以上市販售，不必撲殺。
家衛所長黃金城表示，根據疫情調查，畜主曾到中國旅遊，回來一段時間後覺得身體不適，但症狀不明顯，豬流感爆發可能與此有關。但是許天來對於"畜主何時到中國？何時發病？以及豬何時發病？何時通報？"等細節，都以"涉及個人隱私"迴避不答。
臺東家畜所表示，畜主是在十月十日國慶日前從中國返臺，根據畜主回憶，豬只是在十月十九日發病。防檢局的專家會議因而認為，傳染原因疑為畜主到中國旅遊後遭到感染。
但臺東縣衛生局長呂喬洋表示，畜主的中國旅遊史與豬只新流感時間差太遠，且畜主及親友也無新流感病史。衛生署疾管局副局長林頂表示，養豬場相關的七名工作人員，其中一人兩天前也出現感冒症狀，但診斷為普通流感，快篩為陰性。
專家建議，應優先對豬農施打新型流感疫苗，不過疾管局官員認為，與豬只感染新型流感密切接觸人員，其感染的風險並不高於其他族群，因此施打順序不變。
多位專家都擔心，如果豬只感染的是與人類同型的新型流感，豬只就會再傳染給人類；如果是豬只之間的流感，不排除日後病毒在豬只體內突變重組後再傳給人類。
臺灣疾管局局長郭旭崧表示，H1N1新型流感病毒是人畜共通的傳染病，"臺東豬隻身上的病毒採檢結果，經過基因序列比對，發現與人的H1N1相似度高達九十七．五％，另有二．五％的差異。"黃金城解釋，兩種病毒可能有一點變異，但經過樹狀比對，跟人的新流感幾乎是一致的。
郭旭崧說，H1N1病毒很脆弱，豬肉只要煮熟即可食用，不會有安全疑慮；至於醃肉則要看有沒有醃透，所以無法保證沒事，建議最好還是煮熟吃。許天來亦強調，目前國外沒有豬傳人的證據與案例，病毒也沒有變異。
