李曉紅是重慶大學校長，他建議，將兩大科學院的科研能力，整合到大學裡。潘復生是重慶市科委副主任，他主張，解散兩大科學院，與國防科工委、國家科技部等有關部委進行合併，成立國家科學與技術委員會，管理全國科研機構。
兩位政協委員為何有解散兩院的建議？重慶晨報引述李曉紅的話說，在爭奪科研項目方面，兩大科學院和大學已形成不良競爭，在部分項目的爭取上，大學明顯處於劣勢。但實際上，大學的科研實力可能勝過兩大科學院。若放任大學和兩大科學院互相爭奪項目，科研機構各自為政，科研能力恐將彼此抵消，削弱大陸的科研核心競爭力。
潘復生觀察，國外的國家科學院和教育單位是整合在一起，例如德國，教育和科技歸在教育和研究部；在美國，科技統一由總統科技辦公室管理；在英國，由工業部負責科技整合。目前大陸的科技工作，管理機構如多頭馬車，包括國家科技部、國防科工委等單位，最大的缺點就是研究被分散，結果人力、物力和科研經費重複浪費。
李曉紅建議，兩大科學院整合到大學後，科研人員可轉到大學工作，不從事教學專門從事科研。原兩大科學院編製也可保留。潘復生認為，兩大科學院解散後，與國防科工委、國家科技部、國家自然科學基金委員會合併，成立國家科學技術委員會，管理全國科研機構。
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