1966年6月11日，歷史系教授汪錢（竹字頭）喝殺蟲劑敵敵畏自殺身亡。
1966年7月28日，數學系講師董懷允自殺身亡。
1966年8月4日，西語系教授吳興華在校園內「勞改」時，紅衛兵學生強迫他喝水溝裡從附近化工廠流入的污水。他中毒昏倒，卻被紅衛兵說成是「裝死」。當天晚上吳興華死亡。
1966年8月24，英文教授俞大因（絲字旁＋因）在被抄家和毆打侮辱之後，在家中自殺身亡。
1966年9月2日，中文系中共總支書記程賢策，被當作「黑幫份子」遭到「鬥爭」和侮辱以及毒打後服毒自殺身亡。
1966年10月9日，哲學系心理學教授瀋乃章被「批判鬥爭」和羞辱後自殺身亡。
1968年4月19日，19歲的北京地質學院附屬中學學生溫家駒，因進入北大圖書館翻閱期刊，被北京大學的主要「群眾組織」「新北大公社」的駐二體武鬥連抓到生物小樓低溫實驗室，進行「審訊」，毒打致死。
1968年4月20日，北京大學中國古代史教員李原，被說成「中統特務」，被關押進北京大學辦公樓。當晚即死在辦公樓三樓的一間房子裡。關押他的人說他是自殺的，但他身上傷痕纍纍，所以他的妻子從大連趕到北京見到屍體後，認為是被打死的。他的妻子一直寫信上告，沒有結果。
1968年6月24日，化學系副主任、副教授盧錫錕自殺身亡。在「清理階級隊伍」中，盧被審查「歷史問題」（他在抗日時期曾參加軍隊當翻譯），他在喝下「敵敵畏」後因為非常痛苦，又用刀砍傷自己的手臂。
1968年7月19日，化學系器材室職員林芳（化學系副主任、副教授盧錫錕的妻子）自殺身亡。
1968年8月28日，生物系教授陳同度服毒自殺身亡。
1968年10月16日晚北京大學教務長崔雄昆，從「清理階級隊伍」的集中地（當時全校教師、幹部被命令集中食宿，不得自由回家。）28樓出走，在北京大學紅湖游泳池自殺身亡。
1968年10月16日，物理繫著名老教授饒毓泰，在北京大學燕南園51號上吊身亡。
1968年10月18日，數學力學系教授董鐵寶，在「隔離審查」中自殺身亡。
1968年11月4日晚上，歷史系辦公室主任吳偉能自殺。在「火線學習班」，他在1959年的言論被揭發。他說過「幸福公社不幸福」，關於他的父親在江蘇北部的一個「幸福人民公社」沒飯吃的事情。他投圓明園小湖自殺。第二天開了他的批判會，他被扣上 「反革命」「叛黨」（指自殺）等六頂帽子。
1968年11月11日，數學系教師陳永和作為「反革命小集團」成員在學校被關押時，跳樓自殺身亡。
1968年12月18日，北京大學歷史學教授、副校長翦伯讚夫婦一起自殺於北京大學燕南園64號。
1968年「清理階級隊伍」中，東方語言系教師湯家漢被「審查」。當時的運動領導者聲稱要通過湯家漢「炸開東語系黑堡壘」。湯家漢自殺身亡。
1968年「清理階級隊伍」中，西語系德語專業幹部徐月如自殺身亡。
1968年「清理階級隊伍」中，西語系德語專業教師程遠自殺身亡。
1968年「清理階級隊伍」中，西語系西班牙語專業教師蒙復地自殺身亡。
1968年「清理階級隊伍」中，數學系老師張景昭被關押在學校的時候，一天夜裡死在廁所裡。
1975年4月16日，北京大學圖書館系教授王重民上吊自殺身亡
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