康熙大帝有許多事跡流傳給後世，其中與施琅與間的史事，一直被後世稱頌。
施琅是福建晉江人，原是明朝總兵鄭芝龍的部下，順治三年，清軍攻佔福建，施琅隨鄭芝龍降清。後來鄭芝龍的兒子鄭成功佔據海島反清，招施琅一同反叛，遭到施琅的拒絕，施琅的父親、弟弟、子侄都被鄭成功殺害。康熙即位後，施琅被升遷為福建水師提督。此後，朝廷一直任用施琅打擊鄭成功的海上勢力。
康熙七年，施琅上疏密奏，極力要求加緊進攻臺灣。此時鄭成功己死，其子鄭錦繼續統治，但因兵部意見不一而未付諸實施。施琅也因此被裁撤了福建水師提督之職，授為內大臣。
康熙二十年，鄭錦死，康熙重授施琅為福建水師提督，加太子少保。施琅治軍嚴整，精通水戰，瞭解海上風向氣候，所以戰無不勝。康熙二十二年，他率軍攻打澎湖，眼睛被亂箭射中，但最終取得了勝利，統一了臺灣。施琅因功被封為靖海侯。
捷報傳來時，正值中秋，康熙大帝非常高興，賦詩表揚施琅之功，並賜給他御用袍及其它服飾衣服。施琅上奏推辭侯爵，乞請依內大臣故例賞賜花翎，當時朝廷議論紛紛。但康熙命施琅不要拒絕封爵，並依允他的請求賜他花翎。根據施琅的建議，朝廷在臺灣設立三個縣、一個府、一個巡道。這充分表現了康熙帝對施琅的信任。
康熙二十七年施琅入朝覲見，康熙大帝對他說：「你此前做內大臣共十三年，當時還有人瞧不起你，只有朕對你瞭解深刻，待你優厚。後來海上寇賊佔據臺灣、為害福建，朕對你特加擢用，你不負任命，一舉殲滅寇賊。有人說你恃功自傲，朕便命令你北上來京。又有人建議應當把你留下來而不要再歸遣南方。朕想到動亂之時尚且能夠用人不疑，現在天下己平定，難道反而懷疑你而不放你回去嗎？現在朕命你仍然回覆原任，你應當更加謹慎，以保持自己的功名。」
施琅攻克臺灣後，有人認為他必定要為父報仇，對鄭氏大加殺戮。施琅深明大義的說：「孤島剛剛收復，一旦殺人，恐引起不測。我之所以辛勞苦戰，是為了國家重任，不敢因此而顧及私情。」
康熙大帝用人不疑，施琅兢兢業業，更加盡心效力。康熙三十五年，施琅逝於任上。
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