紐約時報5月24日報導說，日本執政黨自民黨負責人安倍晉三稱：「許多日本人可能感覺此舉(吳儀取消與小泉的會晤)是粗魯無禮的。」日本外務省發言人在被問道中方為何要取消此舉會晤時表示：「我們也不知道。」
而中國外交部也沒有立即解釋吳儀突然回國的原因，但北京方面暗示吳儀突然離開日本可能與近日爆發的口蹄疫有關，而發現疫情的農場距離北京只有兩個小時的車程。
紐約時報說，不管怎樣解釋，取消會晤都已表明這兩個亞洲大國的關係近來已受到抑制：經濟火熱，政治寒冷。中國已成為日本最大的貿易夥伴和最大的投資國，為此吳儀23日在日本經濟新聞社主辦的演講會上，找到向日本企業界演講的機會，然後又同豐田公司社長兼汽車協會主席奧田碩共進午餐。
吳儀在演講中說：「現在，中國和日本正面臨著兩國關係正常化以來的一個非常困難時期，如果我們不盡快扭轉這種局勢，它將損害相互的利益關係，也會傷害兩國人民的感情。」
紐約時報介紹說，在中國爆發大規模反日示威後，日本首相小泉純一郎於4月23日在雅加達與中國國家主席胡錦濤會面，欲修補兩國正在惡化的雙邊關係。接著，便發生了此次的政治冷落。日本媒體稱，中國國家主席胡錦濤在22日會見一個日本代表團時指出，兩國的關係有可能會「毀於一旦」。
而導致兩國關係再次緊張的最明顯的原因是，日本首相小泉純一郎每年都要參拜供奉著包括東條英機在內的二戰明目甲級戰犯的靖國神社。此外，靖國神社還供奉著過去150年中在侵略亞洲鄰國時死亡的約250萬日本人的亡靈。
在吳儀訪問日本期間，中國外交部發言人孔泉在新聞例會上強調說，「目前中日兩國關係最大的困難就是日本首相參拜靖國神社。」但日本外務省發言人在吳儀取消會晤後透露說，日本外交官員曾於23日詢問了中方，想知道此次會晤的取消是否同靖國神社有關，但中方明確否認說：「沒有關係。」
不過，日本首相小泉純一郎當天則輕鬆地談到「會晤取消」一事：「由於他們提出了此次會晤，它應該成為一個很好的機構。如果他們不想會晤，那就不需要了。」
紐約時報分析說，吳儀突然結束訪日並回國，也可能與中國近日爆發的口蹄疫有關。國際先驅論壇發自北京報導說，北京一些觀察家認為，除了口蹄疫外，突然取消會晤不太可能同其它「緊急有關」，因為吳儀除了負責對外貿易外，還兼管著中國的衛生部門，尤其是在薩斯疫情爆發以後。
報導最後指出，由於缺少北京附近爆發口蹄疫的相關信息，已再次令人質疑中國官方是否又隱瞞了疫情，像當初隱瞞薩斯疫情那樣。
