香港東方日報一月二日引述日本《讀賣新聞》報導說，日政府於去年秋天發現此事，已向中國政府提出抗議。根據分析，在所謂「政冷經熱」的中日關係當中，此事有可能令兩國為東海權益的紛爭火上加油。
觀察家指出，日政府此次新發現已證明，除非日本在處理中日關係時堅守原則，否則無法維護國家利益。政府必須檢討現行對華外交政策──試圖不觸怒中國。
兩國在東海經濟專屬區的距離很接近。多年來，日政府已堅持雙方經濟專屬區是由「日中中間線」分隔，但中國拒絕接受日方所定的中間線，聲稱其經濟專屬區伸展至位於沖繩縣以西的大陸架。
中國的天然氣開發，是由中國海洋石油總公司負責，該公司的網頁只列出中國在東海部分採礦區。
報導說，日政府檢查該公司提交美國證券交易委員會的資料，以及全球消息靈通人士蒐集的情報，發現中國有十二個天然氣開採區延伸至日本的專屬經濟水域。
但日本考慮到兩國關係，尚未透露有關中國天然氣井的調查結果。
據消息人士指出，中國已將四個天然氣井保密，其中一個越過日中中間線，另外三個已完全進入日本的經濟專屬區，四個天然氣井距離釣魚島僅數十公里。
日本政府代表去年十月訪問北京，與中國政府代表協商時，出示上述情報，並提出抗議。
中方重申有權在該區開發天然氣，而且對於進行「實際作業」方面自製。日方則一再要求中方澄清，「實際作業」是否指開發天然氣井或具體開發作業。但中方拒絕給予明確答覆。觀察家認為，中國政府的行為，嚴重侵犯日本主權。
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