據美國之音3月16日報導，批評移民歸化局的人說，這一事件只是另一起另人難堪的例子而已。批評人士說，移民歸化局長期以來無法追蹤移民的去向，需要進行改革，甚至應該廢除。
那天早上， 布希總統從報紙上得知移民局這個星期發出通知說，穆罕默德阿塔和馬爾萬舍希獲准在美國學習，而這兩個人正是駕駛飛機撞毀世貿中心大廈的恐怖份子。 得知這個消息後，布希總統絲毫沒有掩飾他的憤怒。 布希說：「我簡直不能相信，我很不高興，十分生氣。當我讀到這條消息的時候，我氣得喝不下去咖啡。」
雖然阿塔和舍希都是合法進入美國的，但是布希總統認為，這一事件表明移民局需要改革。移民局在三百多個陸地、空中和海港負責處理移民入關手續。移民局說，這一不幸的事件是文件積壓的結果。但是布希總統下令全面調查，司法部長阿什克羅福特稱這一事件顯示了移民局的無能，他說移民局在保存記錄方面的失敗令人憂慮。
國會也十分憤怒。眾議院司法委員會主席、共和黨眾議員森森布倫納提出了一項廢除移民局的議案。批評人士說，移民局無法追蹤移民的去向。森森布倫納在哥倫比亞廣播公司的早上節目上說：「學生都從學校畢業了，移民局的學生簽證還沒有發下來，這顯示了移民局有多糟糕。 1996年，國會告訴移民局設立一個學生簽證記錄系統，並且撥了款，但是他們從來沒有著手做，於是鬧劇一場接一場地發生。」
移民局長期以來被指責無法追蹤簽證逾期的人。另外還有人抱怨說，一些移民的公民申請在移民局擱置多年沒有下落。多麗斯邁斯納是克林頓總統政府期間的美國移民局長。邁斯納說：「移民局是一個非常、非常難辦的機構，直到幾年前，移民局一直受到忽略，得不到所需要的資源和現代技術。現在最大的需要是，要允許移民局向前邁進，從上至下進行徹底重組。」
但是問題的癥結部分地在於，美國人對移民問題的看法隨著整個國家的情緒經常在變，移民局是在這樣一種環境下貫徹移民法的。邁斯納說：「我們對移民問題的態度很含糊，對如何對待我們所貫徹的移民規則感到很不確定。在圍繞移民的政治問題上我們總是這樣，這就使得國會很難指出明確的方向，移民局也很難在這樣一種分裂症的情況下發揮功能。」
布希總統對這起最近發生的錯誤沒有解釋，但是他也認為，這一事件顯示了對移民局進行重組的需要。每年經移民局檢查、進出美國的人數平均為五億人。布希總統說：「發生這樣的事情毫無道理。所以我們必須要改革移民局，全力以赴地去改革。對那些領導移民局的官員來說，這是一個警醒。」
布希政府提議對移民局進行全面整頓，給予這個機構更明確的許可權，並請求國會額外撥款五億美元，使得移民局更有能力追蹤移民出入美國的動向。
