日前，曾毅院士在北京大學的一次學術報告會上說，中國愛滋病防治工作存在三個嚴重不足：對愛滋病出現大流行的估計不足；對愛滋病的嚴重危害估計不足；對愛滋病防治工作的投入不足。不解決好這些問題，《中國預防與控制愛滋病中長期規劃(1998-2010年)》將無法實現，控制中國愛滋病大流行就無法保證。
在接受光明日報採訪時，曾毅指出，中國愛滋病流行感染與許多西方國家呈現出越來越相似的趨勢，即由原來是吸毒等高危人群共用注射器感染為主逐漸向性感染的方向轉變，雖然性傳播當前在中國所佔比例不高，但這對於一個擁有上億年輕流動人群的國家來說是很危險的。
他指出，近幾年掃黃掃出的地下暗娼呈上升態勢，與愛滋病的流行遙相呼應。暗娼多數是農村姑娘，被遣送回鄉後，許多姑娘把愛滋病帶到農村，而目前中國農村的愛滋病防治工作相當薄弱。
曾毅說，一旦一個國家的愛滋病感染轉到以性傳播為主，愛滋病的控制工作將更為艱難，國家將不堪重負。
曾毅指出，一般預測認為，通過全球合作，不懈努力，有效的愛滋病疫苗可能在8-10年後才問世，但這是一段很長的時間，愛滋病仍在繼續迅速傳播。
曾毅認為，中國預防與控制愛滋病應該與國際接軌，向發達國家看齊，以科學為基礎，確定正確策略。他建議採取如下全方位措施：
1.開展廣泛、深入、持續的全民愛滋病宣傳教育。
2.強化安全血液供應的法制管理，明確職責，加大宣傳和執法力度。
3.修改「禁娼」和「禁毒」法律中不利於愛滋病防治工作的有關條文，在這項工作完成以前，國務院盡快出臺有關政策，保護和支持醫務衛生人員、社會工作者、民間團體在高危人群中進行預防愛滋病的宣傳教育。
4.加強愛滋病防治中的科學研究。
5.為保證《中國預防和控制愛滋病中長期規劃(1998-2010年)》的落實，必須加大對愛滋病防治工作的經費投入，而且政府投入應該作為愛滋病防治投入的主渠道。
據悉，截止今年6月，中國全國累計報告的愛滋病病毒感染者已有2.6萬例。而專家估計，到2000年底全國實際感染愛滋病病毒的人數已超過60萬。愛滋病已經遍及全國31個省、自治區和直轄市。
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