２００１年８月，國家文物局已正式批准對沉船遺址進行考古發掘的方案。在位於東山海域的鄭成功沉船遺址已經打撈出許多鐵炮、銅銃、炮彈、地雷、瓷器等，其中出土的鐵炮就有４門，更多的文物還埋藏在海底泥沙中。
鄭成功沉船水下考古發掘已經引起了國內媒體的關注，準備對水下考古發掘進行直播。
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